特定のデータをElasticsearchに投入できない

確かに、指定のファイルを投入するとelasticsearchが落ちるようです。
出ていたログを見ますと、以下のようになっていました。NoClassDefFoundError、と。

[2017-02-01T02:15:50,737][ERROR][o.e.b.ElasticsearchUncaughtExceptionHandler] [] fatal error in thread [elasticsearch[Toi0qCP][index][T#1]], exiting
java.lang.NoClassDefFoundError: com/graphbuilder/curve/Point
さ        at java.lang.Class.getDeclaredConstructors0(Native Method) ~[?:1.8.0_92-internal]
        at java.lang.Class.privateGetDeclaredConstructors(Class.java:2671) ~[?:1.8.0_92-internal]

このことから、以下で報告されている既存の不具合ではないかと思います。

discussにも同様の報告がありました。(上のissue元のようです)