Siento la demora, no vi las respuestas antes
Lamentablemente sin subir a versiones mas recientes esto normalmente causa problemas.
A partir de la versión 7.7 hemos cambiado mucho que usa heap de la JVM (Disminuye de forma significativa tu uso de memoria heap de Elasticsearch | Elastic Blog) y por esto podíamos cambiar la configuración de las colas.
Otra cosa en la misma versión cambiábamos el garbage colector de la JVM a G1GC (Garbage First Garbage Collector Tuning) en los releases bundled con JAVA. Esto significa un poco más de uso de la CPU durante casi todo el tiempo, pero no vemos paradas enteras durante el garbage collection como con el anterior CMS.
Así os puede servir probar una versión más reciente de Elasticsearch.