¿Como puedo extraer información de un windows server a un ubuntu server?

Lo único que veo raro en tu configuración (mira que he editado to post para leerlo mejor), es que en cluster.initial_master_nodes puedes dejar uno de los dos nodos o los dos, pero no de manera excluyente.

¿Has revisado los logs de Elasticsearch a ver si te dicen algo?

Yo lo que haría es:

  1. parar los dos nodos
  2. arrancar node1 y ver sus logs, a ver no hay errores
  3. arrancar node2 y comprobar si se une al cluster o no, con un ojo en los logs de node1 para ver si lo registra
  4. si todo va bien, ya puedes usar la API para ver info de tus nodos GET /_cat/nodes?v desde la consola de Kibana por ejemplo